Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POU5F1Q01860 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POU5F1Q01860 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POU5F1Q01860 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 548.7 ms