Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDR2Q01850 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDR2Q01850 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDR2Q01850 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms