Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE1BQ01064 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE1BQ01064 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDE1BQ01064 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE1BQ01064 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms