Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp10Q000W5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp10Q000W5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms