Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGD1P98174 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGD1P98174 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGD1P98174 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGD1P98174 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGD1P98174 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD1P98174 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD1P98174 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD1P98174 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD1P98174 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD1P98174 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGD1P98174 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD1P98174 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD1P98174 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD1P98174 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD1P98174 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FGD1P98174 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FGD1P98174 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FGD1P98174 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FGD1P98174 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGD1P98174 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD1P98174 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD1P98174 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD1P98174 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD1P98174 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD1P98174 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD1P98174 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGD1P98174 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGD1P98174 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGD1P98174 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGD1P98174 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FGD1P98174 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGD1P98174 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGD1P98174 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD1P98174 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD1P98174 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD1P98174 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD1P98174 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD1P98174 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD1P98174 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGD1P98174 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD1P98174 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD1P98174 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD1P98174 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD1P98174 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGD1P98174 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD1P98174 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD1P98174 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD1P98174 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD1P98174 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD1P98174 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FGD1P98174 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD1P98174 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD1P98174 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD1P98174 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD1P98174 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD1P98174 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD1P98174 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD1P98174 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD1P98174 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD1P98174 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD1P98174 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD1P98174 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD1P98174 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD1P98174 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD1P98174 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD1P98174 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD1P98174 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD1P98174 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD1P98174 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms