Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC1P78364 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC1P78364 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC1P78364 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC1P78364 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHC1P78364 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHC1P78364 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC1P78364 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC1P78364 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHC1P78364 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PHC1P78364 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHC1P78364 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC1P78364 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC1P78364 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC1P78364 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC1P78364 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHC1P78364 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHC1P78364 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHC1P78364 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHC1P78364 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHC1P78364 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHC1P78364 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHC1P78364 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHC1P78364 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHC1P78364 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHC1P78364 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms