Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tp53bp1P70399 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tp53bp1P70399 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tp53bp1P70399 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tp53bp1P70399 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 941.2 ms