Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Shox2P70390 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shox2P70390 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shox2P70390 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Shox2P70390 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Shox2P70390 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms