Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS18P62269 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS18P62269 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS18P62269 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS18P62269 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS18P62269 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS18P62269 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS18P62269 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS18P62269 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS18P62269 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS18P62269 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS18P62269 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS18P62269 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS18P62269 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS18P62269 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS18P62269 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS18P62269 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS18P62269 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS18P62269 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS18P62269 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS18P62269 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS18P62269 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS18P62269 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS18P62269 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS18P62269 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS18P62269 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS18P62269 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS18P62269 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS18P62269 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS18P62269 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS18P62269 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS18P62269 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS18P62269 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS18P62269 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS18P62269 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS18P62269 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS18P62269 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS18P62269 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS18P62269 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS18P62269 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS18P62269 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS18P62269 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS18P62269 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS18P62269 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS18P62269 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS18P62269 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS18P62269 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS18P62269 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms