Protein–RNA interactions for Protein: P62082

Rps7, 40S ribosomal protein S7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps7P62082 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rps7P62082 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rps7P62082 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps7P62082 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps7P62082 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps7P62082 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps7P62082 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms