Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCALDP61601 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCALDP61601 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCALDP61601 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCALDP61601 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCALDP61601 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NCALDP61601 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCALDP61601 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCALDP61601 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCALDP61601 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCALDP61601 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCALDP61601 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCALDP61601 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCALDP61601 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCALDP61601 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCALDP61601 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCALDP61601 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCALDP61601 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCALDP61601 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCALDP61601 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCALDP61601 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCALDP61601 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCALDP61601 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCALDP61601 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCALDP61601 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCALDP61601 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCALDP61601 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCALDP61601 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCALDP61601 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCALDP61601 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCALDP61601 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NCALDP61601 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NCALDP61601 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCALDP61601 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCALDP61601 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NCALDP61601 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCALDP61601 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NCALDP61601 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCALDP61601 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCALDP61601 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCALDP61601 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCALDP61601 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCALDP61601 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCALDP61601 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCALDP61601 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCALDP61601 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCALDP61601 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCALDP61601 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCALDP61601 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCALDP61601 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCALDP61601 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms