Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2FP61218 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2FP61218 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR2FP61218 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms