Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM33P57088 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM33P57088 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM33P57088 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms