Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bace1P56818 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Bace1P56818 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bace1P56818 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bace1P56818 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bace1P56818 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bace1P56818 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bace1P56818 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bace1P56818 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bace1P56818 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bace1P56818 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bace1P56818 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bace1P56818 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bace1P56818 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bace1P56818 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bace1P56818 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bace1P56818 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms