Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP6P55212 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP6P55212 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP6P55212 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP6P55212 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP6P55212 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP6P55212 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP6P55212 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP6P55212 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP6P55212 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP6P55212 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP6P55212 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP6P55212 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP6P55212 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP6P55212 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP6P55212 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP6P55212 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASP6P55212 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASP6P55212 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP6P55212 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASP6P55212 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP6P55212 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP6P55212 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP6P55212 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP6P55212 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP6P55212 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP6P55212 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASP6P55212 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP6P55212 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP6P55212 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP6P55212 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP6P55212 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP6P55212 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP6P55212 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP6P55212 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP6P55212 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP6P55212 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP6P55212 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP6P55212 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP6P55212 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP6P55212 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP6P55212 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP6P55212 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP6P55212 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP6P55212 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP6P55212 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP6P55212 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASP6P55212 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP6P55212 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP6P55212 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASP6P55212 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP6P55212 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP6P55212 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP6P55212 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP6P55212 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP6P55212 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASP6P55212 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms