Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1P55194 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp1P55194 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1P55194 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms