Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EMP3P54852 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMP3P54852 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMP3P54852 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMP3P54852 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EMP3P54852 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EMP3P54852 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMP3P54852 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMP3P54852 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EMP3P54852 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EMP3P54852 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EMP3P54852 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EMP3P54852 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMP3P54852 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMP3P54852 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMP3P54852 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EMP3P54852 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMP3P54852 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMP3P54852 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EMP3P54852 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EMP3P54852 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMP3P54852 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMP3P54852 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMP3P54852 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMP3P54852 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMP3P54852 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMP3P54852 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMP3P54852 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMP3P54852 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMP3P54852 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMP3P54852 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMP3P54852 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMP3P54852 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMP3P54852 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMP3P54852 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMP3P54852 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMP3P54852 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMP3P54852 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMP3P54852 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMP3P54852 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EMP3P54852 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms