Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA2P54646 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA2P54646 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA2P54646 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA2P54646 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA2P54646 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRKAA2P54646 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAA2P54646 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRKAA2P54646 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.7 ms