Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC24CP53992 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24CP53992 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms