Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux1P53564 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux1P53564 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cux1P53564 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cux1P53564 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cux1P53564 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cux1P53564 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux1P53564 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux1P53564 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cux1P53564 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cux1P53564 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Cux1P53564 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cux1P53564 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux1P53564 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux1P53564 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux1P53564 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cux1P53564 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Cux1P53564 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cux1P53564 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cux1P53564 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms