Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Map3k1P53349 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Map3k1P53349 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Map3k1P53349 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Map3k1P53349 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Map3k1P53349 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Map3k1P53349 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Map3k1P53349 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms