Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp1P52624 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp1P52624 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upp1P52624 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp1P52624 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp1P52624 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upp1P52624 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upp1P52624 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp1P52624 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp1P52624 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Upp1P52624 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Upp1P52624 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Upp1P52624 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Upp1P52624 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms