Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdi1P50396 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdi1P50396 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdi1P50396 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdi1P50396 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gdi1P50396 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gdi1P50396 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gdi1P50396 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gdi1P50396 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gdi1P50396 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdi1P50396 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdi1P50396 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdi1P50396 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdi1P50396 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gdi1P50396 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdi1P50396 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdi1P50396 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdi1P50396 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gdi1P50396 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gdi1P50396 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gdi1P50396 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdi1P50396 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdi1P50396 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdi1P50396 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gdi1P50396 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdi1P50396 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdi1P50396 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gdi1P50396 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gdi1P50396 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gdi1P50396 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdi1P50396 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gdi1P50396 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdi1P50396 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms