Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOPP49908 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SELENOPP49908 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SELENOPP49908 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SELENOPP49908 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SELENOPP49908 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SELENOPP49908 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SELENOPP49908 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms