Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VEGFCP49767 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VEGFCP49767 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VEGFCP49767 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms