Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT3P49368 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT3P49368 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT3P49368 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT3P49368 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT3P49368 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT3P49368 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT3P49368 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT3P49368 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT3P49368 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT3P49368 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT3P49368 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT3P49368 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT3P49368 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT3P49368 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT3P49368 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT3P49368 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT3P49368 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT3P49368 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT3P49368 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT3P49368 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT3P49368 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT3P49368 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT3P49368 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT3P49368 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT3P49368 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT3P49368 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT3P49368 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT3P49368 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT3P49368 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT3P49368 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT3P49368 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT3P49368 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT3P49368 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT3P49368 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT3P49368 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT3P49368 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT3P49368 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT3P49368 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT3P49368 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT3P49368 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT3P49368 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT3P49368 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT3P49368 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT3P49368 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT3P49368 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT3P49368 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms