Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atoh1P48985 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atoh1P48985 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atoh1P48985 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atoh1P48985 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.7 ms