Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brca1P48754 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brca1P48754 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca1P48754 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca1P48754 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brca1P48754 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brca1P48754 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Brca1P48754 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca1P48754 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Brca1P48754 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca1P48754 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brca1P48754 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brca1P48754 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brca1P48754 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brca1P48754 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca1P48754 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms