Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NESP48681 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NESP48681 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NESP48681 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NESP48681 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NESP48681 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NESP48681 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
NESP48681 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
NESP48681 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NESP48681 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NESP48681 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NESP48681 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
NESP48681 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NESP48681 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
NESP48681 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
NESP48681 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NESP48681 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NESP48681 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
NESP48681 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
NESP48681 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
NESP48681 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NESP48681 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NESP48681 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NESP48681 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NESP48681 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NESP48681 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NESP48681 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NESP48681 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
NESP48681 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
NESP48681 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
NESP48681 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
NESP48681 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NESP48681 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NESP48681 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NESP48681 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NESP48681 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
NESP48681 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NESP48681 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NESP48681 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NESP48681 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NESP48681 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
NESP48681 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NESP48681 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NESP48681 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
NESP48681 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
NESP48681 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NESP48681 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NESP48681 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NESP48681 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NESP48681 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NESP48681 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NESP48681 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NESP48681 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NESP48681 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
NESP48681 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NESP48681 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NESP48681 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NESP48681 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NESP48681 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NESP48681 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NESP48681 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
NESP48681 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NESP48681 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NESP48681 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC41.56■■■■■ 4.24
NESP48681 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
NESP48681 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
NESP48681 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NESP48681 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NESP48681 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC41.55■■■■■ 4.24
NESP48681 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
NESP48681 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
NESP48681 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
NESP48681 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
NESP48681 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NESP48681 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
NESP48681 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.51■■■■■ 4.24
NESP48681 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NESP48681 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
NESP48681 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
NESP48681 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
NESP48681 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
NESP48681 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
NESP48681 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
NESP48681 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NESP48681 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NESP48681 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NESP48681 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NESP48681 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NESP48681 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NESP48681 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NESP48681 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NESP48681 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NESP48681 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NESP48681 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
NESP48681 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NESP48681 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NESP48681 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
NESP48681 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NESP48681 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
NESP48681 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.4 ms