Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ALDH1A3P47895 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALDH1A3P47895 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 420.3 ms