Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nedd4P46935 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nedd4P46935 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nedd4P46935 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nedd4P46935 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms