Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Brcc3P46737 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brcc3P46737 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brcc3P46737 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brcc3P46737 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Brcc3P46737 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Brcc3P46737 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms