Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
InaP46660 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
InaP46660 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InaP46660 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InaP46660 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InaP46660 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InaP46660 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
InaP46660 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
InaP46660 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
InaP46660 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
InaP46660 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
InaP46660 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
InaP46660 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
InaP46660 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
InaP46660 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
InaP46660 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InaP46660 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InaP46660 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InaP46660 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InaP46660 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InaP46660 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
InaP46660 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InaP46660 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
InaP46660 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
InaP46660 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
InaP46660 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
InaP46660 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InaP46660 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
InaP46660 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InaP46660 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InaP46660 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
InaP46660 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
InaP46660 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
InaP46660 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
InaP46660 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
InaP46660 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
InaP46660 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
InaP46660 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
InaP46660 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InaP46660 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InaP46660 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
InaP46660 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
InaP46660 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
InaP46660 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InaP46660 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
InaP46660 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
InaP46660 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
InaP46660 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
InaP46660 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms