Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf1P46099 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf1P46099 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf1P46099 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klf1P46099 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf1P46099 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf1P46099 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf1P46099 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf1P46099 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf1P46099 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Klf1P46099 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klf1P46099 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klf1P46099 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.1 ms