Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
RANGAP1P46060 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RANGAP1P46060 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RANGAP1P46060 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms