Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc1a2P43006 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc1a2P43006 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms