Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC1A2P43004 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC1A2P43004 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A2P43004 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms