Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTHFRP42898 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFRP42898 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFRP42898 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms