Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GARSP41250 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARSP41250 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARSP41250 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARSP41250 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GARSP41250 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARSP41250 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARSP41250 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARSP41250 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARSP41250 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARSP41250 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GARSP41250 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GARSP41250 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GARSP41250 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARSP41250 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARSP41250 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARSP41250 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARSP41250 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GARSP41250 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GARSP41250 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GARSP41250 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GARSP41250 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GARSP41250 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GARSP41250 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GARSP41250 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARSP41250 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARSP41250 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARSP41250 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARSP41250 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARSP41250 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARSP41250 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GARSP41250 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GARSP41250 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GARSP41250 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARSP41250 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARSP41250 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARSP41250 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GARSP41250 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GARSP41250 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARSP41250 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GARSP41250 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARSP41250 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARSP41250 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARSP41250 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARSP41250 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARSP41250 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARSP41250 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GARSP41250 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARSP41250 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARSP41250 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARSP41250 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GARSP41250 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARSP41250 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARSP41250 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARSP41250 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARSP41250 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARSP41250 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARSP41250 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GARSP41250 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GARSP41250 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms