Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VHLP40337 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VHLP40337 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VHLP40337 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VHLP40337 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VHLP40337 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VHLP40337 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VHLP40337 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VHLP40337 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VHLP40337 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VHLP40337 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VHLP40337 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VHLP40337 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VHLP40337 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VHLP40337 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VHLP40337 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VHLP40337 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VHLP40337 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VHLP40337 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VHLP40337 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VHLP40337 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VHLP40337 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VHLP40337 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VHLP40337 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VHLP40337 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VHLP40337 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VHLP40337 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VHLP40337 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VHLP40337 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VHLP40337 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VHLP40337 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VHLP40337 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VHLP40337 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VHLP40337 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VHLP40337 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VHLP40337 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VHLP40337 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VHLP40337 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VHLP40337 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VHLP40337 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VHLP40337 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VHLP40337 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VHLP40337 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VHLP40337 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms