Protein–RNA interactions for Protein: P40048

PTP3, Tyrosine-protein phosphatase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP3P40048 ROX3YBL093C 663 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 GAL7YBR018C 1101 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt10.29□□□□□ -0.76
PTP3P40048 HGH1YGR187C 1185 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP3P40048 SPC2YML055W 537 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP3P40048 AAD14YNL331C 1131 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PLB3YOL011W 2061 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP3P40048 COM2YER130C 1332 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP3P40048 HMS1YOR032C 1305 nt10.28□□□□□ -0.76
PTP3P40048 PRP38YGR075C 729 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 SFK1YKL051W 1062 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 HRT3YLR097C 1035 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 BUR2YLR226W 1188 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 APT1YML022W 564 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 ATG16YMR159C 453 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 TPT1YOL102C 693 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 FDH1YOR388C 1131 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 TAF3YPL011C 1062 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 LGE1YPL055C 999 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YPL191CYPL191C 1083 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 INA1YLR413W 2028 nt10.27□□□□□ -0.77
PTP3P40048 Q0032Q0032 291 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP3P40048 URA3YEL021W 804 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PEX14YGL153W 1026 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP3P40048 STE50YCL032W 1041 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP3P40048 LAG2YOL025W 1983 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP3P40048 MTH1YDR277C 1302 nt10.26□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PFS1YHR185C 714 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PPX1YHR201C 1194 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PSF2YJL072C 642 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP3P40048 ALB1YJL122W 528 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YJL215CYJL215C 360 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YPQ1YOL092W 927 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP3P40048 ALG12YNR030W 1656 nt10.25□□□□□ -0.77
PTP3P40048 OPT1YJL212C 2400 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RPT3YDR394W 1287 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 CIC1YHR052W 1131 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 CUP1-1YHR053C 186 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 CUP1-2YHR055C 186 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PMU1YKL128C 888 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RPB8YOR224C 441 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 SPO19YPL130W 672 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 SRM1YGL097W 1449 nt10.24□□□□□ -0.77
PTP3P40048 TRP2YER090W 1524 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP3P40048 CRD1YDL142C 852 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP3P40048 CYT2YKL087C 675 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP3P40048 MAC1YMR021C 1254 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP3P40048 MGE1YOR232W 687 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YOR283WYOR283W 693 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RFC1YOR217W 2586 nt10.23□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YCR108CYCR108C 192 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PUP3YER094C 618 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YGL230CYGL230C 444 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RPN13YLR421C 471 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YML119WYML119W 1074 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 SEN15YMR059W 387 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PTH2YBL057C 627 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RRT2YBR246W 1164 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RGL1YPL066W 1440 nt10.22□□□□□ -0.77
PTP3P40048 GFA1YKL104C 2154 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RVS161YCR009C 798 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YDR278CYDR278C 318 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 RPB7YDR404C 516 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YGR273CYGR273C 525 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 MRP49YKL167C 414 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YKL169CYKL169C 384 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 PML1YLR016C 615 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 TIS11YLR136C 858 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 GPN3YLR243W 819 nt10.21□□□□□ -0.77
PTP3P40048 YKL133CYKL133C 1392 nt10.21□□□□□ -0.78
PTP3P40048 MRS6YOR370C 1812 nt10.21□□□□□ -0.78
PTP3P40048 RDI1YDL135C 609 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 FDC1YDR539W 1512 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YHL012WYHL012W 1482 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YJR157WYJR157W 363 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 TEF4YKL081W 1239 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 SMD2YLR275W 333 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YNL108CYNL108C 813 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 CPA1YOR303W 1236 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 MRS2YOR334W 1413 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 CST26YBR042C 1194 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 TIM50YPL063W 1431 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 snR19snR19 568 nt10.2□□□□□ -0.78
PTP3P40048 POX1YGL205W 2247 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 MEP1YGR121C 1479 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YHR180WYHR180W 492 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 DID4YKL002W 699 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YBL071CYBL071C 309 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 MBF1YOR298C-A 456 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YOR342CYOR342C 960 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YAT1YAR035W 2064 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 CKI1YLR133W 1749 nt10.19□□□□□ -0.78
PTP3P40048 snR63snR63 255 nt10.18□□□□□ -0.78
PTP3P40048 LRS4YDR439W 1044 nt10.18□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YRB2YIL063C 984 nt10.18□□□□□ -0.78
PTP3P40048 CMC1YKL137W 336 nt10.18□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YNL013CYNL013C 378 nt10.18□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt10.18□□□□□ -0.78
PTP3P40048 YOR238WYOR238W 912 nt10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.3 ms