Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tjp1P39447 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tjp1P39447 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tjp1P39447 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tjp1P39447 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tjp1P39447 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tjp1P39447 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms