Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EIF4A3P38919 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF4A3P38919 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF4A3P38919 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms