Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Folr1P35846 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Folr1P35846 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Folr1P35846 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Folr1P35846 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Folr1P35846 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Folr1P35846 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Folr1P35846 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Folr1P35846 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Folr1P35846 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms