Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPA3P35244 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPA3P35244 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPA3P35244 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPA3P35244 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA3P35244 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA3P35244 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA3P35244 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA3P35244 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPA3P35244 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPA3P35244 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA3P35244 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA3P35244 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPA3P35244 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPA3P35244 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPA3P35244 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPA3P35244 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPA3P35244 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA3P35244 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA3P35244 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA3P35244 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPA3P35244 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPA3P35244 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPA3P35244 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPA3P35244 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms