Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN7P35236 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN7P35236 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN7P35236 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN7P35236 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.1 ms