Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXA6P31267 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXA6P31267 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA6P31267 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA6P31267 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms