Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnnd1P30999 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnd1P30999 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnd1P30999 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnd1P30999 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms