Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A1P30825 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A1P30825 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC7A1P30825 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC7A1P30825 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC7A1P30825 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC7A1P30825 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC7A1P30825 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC7A1P30825 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC7A1P30825 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A1P30825 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A1P30825 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC7A1P30825 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms