Protein–RNA interactions for Protein: P30041

PRDX6, Peroxiredoxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX6P30041 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX6P30041 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDX6P30041 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDX6P30041 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms